Сергей Абалакин родился 22 декабря 1972 года в Норильске. 

В 1995 году окончил Донбасский горно-металлургический институт (специальность – «Автоматизация промышленных процессов»), затем продолжил обучение в Международной академии маркетинга и менеджмента («Финансы и кредит»), а в 2000 году получил диплом экономиста по специальности «Страхование» Финансовой академии при Правительстве Российской Федерации. 

Карьеру в страховании начал в 1996 году в страховой компании «Согласие», где прошел путь от специалиста до советника Дирекции ОСАГО. 

С 2003 года занимал различные должности в компании «РОСНО». В частности, в 2004-2008 годах являлся директором департамента страхования автотранспорта Московской региональной дирекции, заместителем директора Центра страхования автотранспорта. 

В 2008 году продолжил карьеру в Киеве в должности операционного директора страховой компании «Allianz Украина». В 2009 году вернулся в Россию и возглавил Операционный центр «Альянс Евразия Бизнес Сервис» ОАО «РОСНО». 

В 2010-2011 годах был заместителем генерального директора ОСАО «Россия». 

В сентябре 2011 года Сергей Абалакин назначен директором департамента стратегии и развития ERGO в России. В настоящее время отвечает за разработку и внедрение стратегического плана развития компании, оптимизацию бизнес-процессов.